Het FLDO gebruikt voor een verwantschapsonderzoek, afhankelijk van de onderzoeksvraag, drie verschillende DNA systemen, te weten: autosomale microsatellieten voor de klassieke vaderschapsaanvraag, Y-chromosomale microsatellieten voor het traceren van verwantschap in de mannelijke lijn en mtDNA sequentieanalyse voor het traceren van verwantschap in de vrouwelijke lijn. Soms worden meerdere technieken gecombineerd. In alle gevallen wordt gestreefd naar een zo groot mogelijke zekerheid.

 (klik op links voor uitgebreidere uitleg)